步步助力:仁东医学“DRTU”模型辅助泌尿肿瘤临床关键决策,助力转化研究

来源:云南网 发表时间:2020-1-10 22:03:31

在2019年第26届全国泌尿外科学术会议(CUA)上,上海交通大学医学院附属仁济医院泌尿科董柏君教授发表演讲,分享了与仁东医学的合作成果——基于cfDNA多基因靶向测序指导mCRPC(转移性去势抵抗前列腺癌)治疗决策研究,证明了mCRPC中血液可以代替组织进行基因检测,并从基因层面发现了阿比特龙和奥拉帕利等相关药物的分子标志物,用于指导mCRPC患者的个体化用药。在大会肿瘤学组分会场,仁济医院樊连城教授作《中国前列腺癌患者去势抵抗前后基因组学图谱比较》发言,介绍了与仁东医学合作的前列腺癌精准诊疗基因Panel设计,以及基于测序结果进行mCSPC(转移性去势敏感性前列腺癌)分子分型的方案和技术路线。

肿瘤精准医疗以基因精准检测为前提,随着新的靶向药物及免疫药物的不断上市,基于NGS的用药指导检测逐渐成为肿瘤治疗的刚需及常规手段,越来越多的临床医生及团队拥抱这项技术,越来越多的患者开始临床受益。

与董教授和樊教授精诚合作的仁东医学,自2015年成立以来,始终致力于践行精准医疗,并深耕泌外肿瘤等特色瘤种领域,打造细分瘤种精准诊疗全程闭环。仁东虽入局较晚,却在短短四年内成为后起之秀,取得了可观的成绩:2017年,仁东医学推出首款肿瘤精准免疫治疗整体解决方案、首款针对肿瘤免疫治疗疗效的ctDNA PANEL。2018年,仁东医学推出前列腺癌诊断产品,亮相CSCO。2019年,公司发布肾癌、尿路上皮癌基因检测产品,报告自动化平台及患者管理平台,在EAU(欧洲泌尿外科协会)发布最新科研成果。数年来,仁东医学团队成员发表国际文章200余篇。

据仁东医学COO曹建军透露,仁东的产品从立项、科研再到推向市场,差不多用时一年。CEO金鸽表示,这样的产品转化速度得益于仁东内部精纯打磨的一套产学研一体化“DRTU”产品研发管理模式。“DRTU”分别指代Demand、Research、Translation、Upgrade,即D-挖掘临床需求、R-合作科学研究、T-产品验证转化以及U-大数据迭代更新。

Demand——挖掘真实临床需求

仁东医学总监杨一宁认为真正具有临床应用价值的产品都要经过临床实践应用的验证,而仁东医学的临床产品设计始终依从始于临床需求(Demand)终于临床落地的原则。

由此,医学中心匠心打造出一支具有丰富科研经验的复合型(医学/生物学/药学等)团队以孵化符合临床需求的产品: 在发掘临床需求的过程中,医学联络官(MSL)作为仁东医学与医生对接的桥梁角色,对外通过临床学术交流/随访等方式与临床医生进行深入沟通,系统收集各区域肿瘤专家的临床痛点;对内及时反馈来自临床一线的信息,为公司后台医学研发部门的科研项目设计提供基础。

医学中心的研发人员及遗传咨询师则负责在公司内部将一线临床需求孵化成能够解决临床棘手问题的产品。医学产品讲究证据落地,而证据离不开数据的支撑,基于此仁东自主研发了一站式数据信息交互工作站-海计系统,它通过打通临床表型-基因组数据,不断积累证据以辅助临床决断。

与临床医生探讨真实临床需求

以前列腺癌患者的临床诊治为例,在经过数年的治疗后,患者病灶往往会发生转移,对内分泌治疗产生抵抗,到达mCRPC阶段。国际上的前列腺癌数据库研究发现,患者对治疗药物的敏感性往往与某个或者数个基因突变密切相关,但中国患者的实际临床表现与理论研究结果仍存在许多差异。例如,致病基因突变与理论不一致,甚至出现许多临床意义不明的突变等。

另一方面,部分晚期mCRPC患者,尽管总体的治疗有效时间只有2-3年左右,但不少患者仍然可以通过一定的治疗手段延长生存时间,提高生存质量。临床研究表明,对于有明确DNA修复基因缺陷的mCRPC患者,使用PARP抑制剂奥拉帕利后有效率达88%,整个有效时间达10-12个月。但临床同时遇到的问题是,mCRPC阶段的患者约有80%以上发生了骨转移,如果进行常规的组织检测手段,通过骨穿刺获取病人肿瘤组织进行基因检测,有创伤、耗时长,增加了患者的痛苦。

针对mCRPC这两个难题,仁济医院泌尿科董柏君教授需要探索基因检测对于治疗转移性前列腺癌阶段的中国患者是否具有价值,以及使用肿瘤组织外周血ctDNA检测替代骨穿刺组织检测的可行性。

基于仁东医学与仁济医院泌尿科密切而长续的合作关系,华东MSL将董教授的思考和需求带给了团队内部。团队围绕设计研发基因检测工具来帮助医生实现前列腺癌的诊断分层,收集、整理中国人自己的前列腺癌数据库以辅助制定有效治疗方案两大需求,紧锣密鼓的开展工作。双方合作的成果,便呈现为最近CUA董教授所作的《mCRPC治疗:在基因检测基础上的精准靶向治疗》学术报告。

Research&Translation——科学研究转化落地

放眼全球肿瘤精准医疗领域,一年一度的ASCO、ESMO、CSCO上,肿瘤相关最新研究成果、治疗产品层出不穷。临床治疗愈发倚重基因检测,产品设计始终注重发掘临床现状,两者相辅相成,从临床概念向基因产品的转化持续加速。在仁东“DRTU”模型中,“R”-合作科学研究、“T”-产品验证转化阶段,团队亦始终紧跟临床,邀请医生全程深度参与。

从医生给出的概念轮廓,到一款产品具体的骨架血肉,仁东首先要做的是从技术上验证产品是否可行,产品敏感性和特异性能否达到要求。仁东医学CTO赵国栋所强调的这一点,在产品设计验证的全过程中得到了印证。

仁东医学拥有定量PCR、Sanger测序、IHC、NGS、数字PCR、莱卡病理平台多种主流检测平台,以及UMT分子标签技术、Super CNV、Iseq Analysis一键式数据分析系统,独有的Tumor-specific Driver Identification (TDI)算法等生信分析平台等。仁东团队依托强大的技术力量,从技术论证,商业论证,到产品设计,底层技术研发,产品小试、中试、大试,性能验证,到多中心的回顾性和前瞻性研究等环节,始终接入临床意见与反馈,确保产品解决痛点,真正落地。

在前述了解董教授关于mCRPC治疗的需求基础上,仁东医学迅速联合全国八家泌尿外科中心参与mCRPC阶段替代组织活检的ctDNA基因检测产品研发。依据前列腺癌的特征,仁东与仁济医院合作研发设计了针对前列腺癌的多基因组合物,即“前列腺癌66基因”Panel。产品研发前后用时近一年。

与普通肿瘤个体化用药的基因检测产品不同,前列腺癌66基因是一款面向前列腺癌患者诊疗一体化的产品,可以帮助医生对前列腺癌患者进行分子分型,预后分层,预测多西他赛类化疗、铂类化疗、免疫治疗等治疗方案的有效性。其中,该产品通过血液ctDNA检测mCRPC阶段患者是否具有明确DNA修复基因突变,从而预测PARP抑制剂的有效性。

经过一年的临床验证,董教授团队发现,前列腺癌发展至mCRPC阶段后,出现了很多耐药的分子通路的改变;其次,利用外周血的检测,董教授团队发现了DNA修复基因缺陷的患者,给有条件的患者用上了奥拉帕利或铂类药物治疗,结果显示12例患者有11例有效。针对这部分难治性前列腺癌患者,经过了全身化疗,经过了阿比特龙治疗,在目前尚无有效治疗方案推荐的情况下,通过分子诊断,团队终于找到一个优选治疗方案。

由仁东助力,经合作科学研究(R)及产品验证转化(T),再经历临床验证,董柏君教授收治mCRPC患者的思考与探索找到了最优解,患者病情得到切实改善,团队也实现了学术和临床的双重突破。在产品开发过程中,因为跟临床保持了紧密互动,最终的产品很快在市场上引起了良好反响。

Upgrade——AI、大数据迭代更新

鉴于中国患者的实际临床表现及理论研究结果与国际前列腺癌数据库之间存在的诸多差异甚至不一致,国内前列腺器患者临床样本的搜集、梳理、完善与迭代具有开创性的意义。在仁东,经由D、R、T环节的良好铺垫,和临床专家一起打造出来的panel,推出去后还需要不停迭代才能得到更好的应用与呈现。这也正是仁东DRTU之“U”的价值所在。

仁东医学下设上海仁东医学检验所和北京仁东数科生物医学研究院,同时也是中科院上海健康科学研究所及上海交大医学院所建的科研联合实验室。在与仁济医院的合作中,仁东通过检测并收集千余例前列腺癌患者的分子诊断与临床用药信息,生成全面、综合的患者数据库,可用于指导给出适合中国前列腺癌患者的精准诊断与治疗方案。

而随着前列腺癌66基因产品的推出,这项由仁济医院牵头,覆盖全国八家前列腺癌研究中心的ctDNA检测替代组织活检的mCRPC研究,也在国内迅速扩大影响力。仁东医学与全国泌尿外科肿瘤领域前100的医院建立了联系或合作,其中包括仁济医院、上海十院、长海医院、北大第一医院、华西医院及中山大学附属肿瘤医院等泌尿外科的龙头医院。随着合作的扩大,仁东医学正在研发新一代的覆盖更多基因检测项目的诊疗一体化产品,并预计在今年年底上线从分子分型到临床随访信息的全面、综合的中国前列腺癌患者数据库。

呈几何级数增长的数据库,迅速衍生出临床及学术价值。一项始于仁济医院的探索多西他赛类化疗、铂类化疗、内分泌治疗、激素治疗等治疗方案对于转移性去势抵抗性前列腺癌患者的有效性研究已经取得了阶段性的成果。据董柏君教授透露,该项研究覆盖全国38家医院的前列腺癌患者,验证了国际前列腺癌数据库中与阿比特龙、多西他赛、铂类化疗等治疗方案的有效性密切相关的基因突变,同时也发现了过去临床意义不明的基因突变的指导意义。仁东医学联合仁济医院等合作医院,将陆续发表该项研究的最新成果。

通过积累与迭代,前列腺癌分子诊断与临床用药的数据库,最终惠及了患者,实现了个体化精准治疗。这也符合仁东的初衷:深耕特色瘤种,打造泌尿肿瘤精准诊疗的闭环,辅助临床关键决策。

在这个过程中,仁东医学从临床需求出发、到产品研发落地,应用“DRTU”模型打通产学研一体化壁垒,实现了临床科研、文章发表、产品转化以及中国细分瘤种中最大最全的队列的数据积累。快速的成果转化落地充分体现了仁东医学团队在资源调配与管理方面的实力与潜力。2017年,是仁东与中国泌尿外科肿瘤精准治疗一同走向产业化的“元年”。

未来,仁东医学将以发布的前列腺、肾、尿路上皮肿瘤诊疗产品的研发落地模式为范本,通过“DRTU”模型持续进行产品迭代更新与创新诊疗一体化产品研发,在更多瘤种中做特色深耕,助力临床医生帮助到更多患者,助力中国肿瘤精准诊疗快速发展。



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